根据近十几年来国内外的报道，磁疗的治疗作用主要有下列几种：
        1. 止痛作用
        痛觉生理比较复杂，有的问题至今尚未解决，根据目前磁疗的临床观察，磁疗确有止痛作用，但是实验研究的支持还不够。
磁疗的止痛作用可能是多方面的，首先磁疗能改善血液循环和组织营养，因而可纠正缺血、缺氧、水肿、致痛物质等导致的疼痛。其次磁场能提高致病物质分解酶的活动，使缓激肽、组织胺 、5-羟色胺等致痛物质分解或转化，从而达到止痛的目的。此外，磁场作用于穴位，使穴位的生理生化发生变化，达到疏通经络、调和气血、产生止痛作用。
        在临床上动磁场止痛较快，但不巩固；静磁场止痛较慢，但一旦出现效果，止痛时间保持较长。许多单位报道，磁疗止痛效果快慢不一，有的立即止痛，有的要24-48小时或更长。但大多数病人在磁疗后数分钟至数十分钟即能获得止痛效果。各种疼痛，如软组织损伤痛、神经痛、炎性疼痛、脏器疼痛、癌性疼痛等，磁疗均能减轻；而且疼痛减轻后其它症状也往往相继改善。如结肠炎病人，磁疗后下腹痛减轻，里急后重症状也随着很快减轻或消失，大便成形，次数减少等。
        2. 镇静作用
        磁疗的镇静作用表现在磁疗后改善睡眠状态，延长睡眠时间，缓解肌肉痉挛，减轻瘙痒等。磁疗的镇静作用可能与磁疗对经络和神经的调节作用有关。
        3. 消炎作用
        磁疗对炎症的疗效已有很多报道 ，在动物实验上也得到支持。如包头医学院用290MT的恒定磁场作用于右旋糖酐溶液引起的炎症，有明显抗炎作用；日本西田绣太郎等用120MT的50周交流磁场治疗鼠人工Adjuvant关节炎（细胞免疫性炎症），证明对炎症有显著的抑制作用；前苏联COKOLOB对热水（50℃）引起的兔耳炎症，用200MT静磁场作用，对炎症有抑止作用。
        磁疗的抗炎作用，很可能是由于血循环加强，组织通透性提高，从而使炎症产物得以及时排除，水肿减轻，组织酸中毒改善，一些酶（组织胺酶，缓激酞酶，乙酰胆碱酯酶等）的活性提高。此外，磁场对机体免疫力的提高，使水分子团变小，分子链变短，PH值增加等也对炎症的消散有一定的影响。至于磁场对细菌的影响，实验研究的结果目前还不一致。
        4．消肿作用
        磁疗消肿在临床和实验上均得到证实。慢性炎症和软组织损伤引起的组织局部水肿，经磁疗后能很快减轻或消失。磁疗消肿的原因，主要是局部微血管扩张，血流加速，使渗出物吸收和消散。
        5．降低血压
        高血压病人的毛细血管动脉常处于痉挛状态，管壁张力高，管腔狭小。磁疗通过对经络和植物神经的调节作用，使毛细血管动静脉管径均扩大，血液循环的外周阻力降低，微循环功能改善，从而导致血压下降。此外，磁疗后睡眠好转，高级神经的调节功能得到改善，对血压下降也有一定影响。
        6．对肿瘤的作用
        磁疗对良性和恶性肿瘤均有一定的影响，可使良性肿瘤，如纤维瘤、脂肪瘤、粉瘤、淋巴瘤、腱踃囊肿等缩小或消失。对恶性肿瘤，如消化道腺癌、淋巴癌、肝癌、纤维肉瘤等亦能缩小肿块和改善症状。对肿瘤的作用原理目前还不清楚，有待进一步研究。